Das Managementteam des DBM ist das Organ für die Festlegung der Strategie und für operative Entscheidungen. Es setzt sich aus dem Leiter des Departements, der Geschäftsführerin und sechs Leiterinnen und Leitern der Forschungsgruppen zusammen, die jeweils für die Koordination eines bestimmten Tätigkeitsbereichs («Ressort») verantwortlich sind. Das Managementteam wurde von der KOG genehmigt und trifft sich einmal im Monat unter dem Vorsitz des Leiters des Departements.

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